新聞中的新冠病毒核酸檢測方法到底是什么?
國務(wù)院聯(lián)防聯(lián)控機制于2月17日召開新聞發(fā)布會。對于目前核酸檢測試劑檢測率不穩(wěn)定的問題,北大一院主任醫(yī)師王貴強解釋,核酸檢測本身的穩(wěn)定性是很好的。出現(xiàn)一些所謂檢不出的情況或者假陰性的情況,主要原因是任何檢測方法都有一個敏感性的問題。
核酸檢測,是指通過特殊的技術(shù)手段檢測臨床樣本中是否存在特定的病原體核酸,從而診斷患者的感染原因。此次新冠病毒是單鏈RNA病毒,根據(jù)《新冠病毒感染的肺炎診療方案(試行第五版)》(下文簡稱診療方案)建議,針對疑似病例的確診,需要具備以下病原學(xué)證據(jù)之一者,即為確診病例:
呼吸道標(biāo)本或血液標(biāo)本實時熒光RT-PCR檢測新型冠狀病毒核酸陽性;
呼吸道標(biāo)本或血液標(biāo)本病毒基因測序,與已知的新型冠狀病毒高度同源;
診療方案中提到了兩種檢測方式,實時熒光RT-PCR和基因測序。小編分別為大家做簡要介紹:
實時熒光RT-PCR,即實時熒光反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)。它首先將提取的病毒基因組RNA,通過反轉(zhuǎn)錄變成互補DNA(cDNA)。然后再用病原體特異性的引物,以cDNA作為模板擴增病原體核酸序列。因為擴增的過程中熒光染料能同步整合在產(chǎn)物上,所以研究者可以通過熒光信號的強弱,進行實時檢測。
基因測序是目前使用最為廣泛的叫新一代測序(Next generation sequencing,NGS)(后面簡稱NGS技術(shù))。我們比較熟悉的無創(chuàng)產(chǎn)前檢測(NIPT)使用的就是這項技術(shù)。在新冠病毒診斷中,NGS技術(shù)首先將病毒RNA制備成測序儀可以識別和分析的DNA文庫,然后在測序儀上同時對數(shù)以百萬計的核酸序列進行檢測。檢測結(jié)果經(jīng)生物信息學(xué)軟件處理,最后向我們展現(xiàn)出病毒相關(guān)序列信息。相比2003年SARS疫情花了2-3個月確定病原體,中國科學(xué)家在此次武漢疫情爆發(fā)短短2-3周內(nèi),就通過基因測序的方法鑒定出新型冠狀病毒,并成功繪制出其全基因組序列信息。這項技術(shù)的巨大成功,不僅使國內(nèi)診斷企業(yè)能快速研發(fā)用于新冠病毒診斷的實時熒光RT-PCR試劑盒,更向全世界展示了中國有先進的技術(shù)能力幫助政府有效地掌握并控制疫情。即使到了疫情攻堅戰(zhàn)的此刻,NGS技術(shù)仍然在解析第二代、第三代病毒變異情況和追蹤病毒起源及演化方面,扮演著不可替代的核心作用。
央廣記者也曾到中部戰(zhàn)區(qū)總醫(yī)院疾病預(yù)防控制科加強型生物安全二級負(fù)壓實驗室,實地探訪了新冠病毒核酸檢測流程。
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