trizol法提取RNA的方法及每一步的原理
實(shí)驗(yàn)步驟:
1. 提取組織RNA時(shí),每50~100mg組織用1ml Trizol試劑對組織進(jìn)行裂解:提取細(xì)胞RNA時(shí),先離心沉淀細(xì)胞,每5~106個(gè)細(xì)胞加1ml Trizol后,反復(fù)用槍吹打或劇烈震蕩以裂解細(xì)胞;
2. 將上述組織或細(xì)胞的Trizol裂解液轉(zhuǎn)入EP管中,在試問15~30℃下放置5分鐘;
3. 在上述EP管中,按照每1mlTrizol后加0.2ml氯仿的量加入氯仿,蓋上EP管蓋子,在手中用力震蕩15秒,在室溫下(15~30℃)放置2~3分鐘后,12000g(2~8℃)離心15分鐘;
4. 去上層水相置于新EP管中,按照每1mlTrizol加0.5ml異丙醇的量加入異丙醇,在室溫下(15~30℃)放置10分鐘后,12000g(2~8℃)離心10分鐘;
5. 棄上清,按照每1ml Trizol加1ml75% 乙醇進(jìn)行洗滌,渦旋混合,7500g(2~8℃)離心5分鐘,棄上清;
6. 讓沉淀的RNA在室溫在自然干燥;
7. 用Rnase-free water 溶解RNA沉淀
各試劑的作用:
1、 TRIZOL
主要成分是苯酚。苯酚的主要作用是裂解細(xì)胞,使細(xì)胞中的蛋白,核酸物質(zhì)解聚得到釋放。苯酚雖可有效地變性蛋白質(zhì),但不能完全抑制RNA酶活性,因此TRIzol中還加入了8-羥基喹啉、異硫氰酸胍、β-巰基乙醇等來抑制內(nèi)源和外源RNase(RNA酶)。
TRIZOL是從細(xì)胞和組織中提取總RNA的即用型試劑,在樣品裂解或勻漿過程中,TRIZOL能保持RNA完整性。加入氯仿后,溶液分為水相和有機(jī)相,RNA在水相中。取出水相,用異丙醇可沉淀回收RNA。
※0.1%的8-羥基喹啉可以抑制RNase,與氯仿聯(lián)合使用可增強(qiáng)抑制作用。
※異硫氰酸胍屬于解偶劑,是一類強(qiáng)力的蛋白質(zhì)變性劑,可溶解蛋白質(zhì)并使蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)消失,導(dǎo)致細(xì)胞結(jié)構(gòu)降解,核蛋白迅速與核酸分離。
※β-巰基乙醇的主要作用是破壞RNase蛋白質(zhì)中的二硫鍵。
2、 氯仿
為有機(jī)溶劑與水互不相溶,RNA(核糖核“酸”的鹽型)是離子化合物,溶于水相
3、異丙醇
能與與任意比例的水混合,因此加入異丙醇,能夠奪取RNA/DNA周圍的水分,RNA/DNA能夠聚集而發(fā)生沉淀。